1. إعداد المزيد من الصيادلة المتخصصين، تلبية لحاجة البلاد ولمواكبة التوسع المتزايد في حركة تداول الدواء المستقبلية.

2. إعداد كوادر متخصصة، ذات كفاءة عالية ومتميزة، للمساهمة في التطور المرتقب في التصنيع الدوائي.

3. تطوير قدرات الصيادلة لمواكبة المفاهيم العالمية الحديثة في الرعاية والممارسة الصيدلية.

4. إعداد كوادر متخصصة تسهم في إثراء حركة البحث العلمي لتحقيق جملة من الأهداف تشمل:

أ‌. تحويل الثروة السودانية الهائلة من النباتات الطبية الي أشكال دوائية.

ب‌. تصنيع الخامات الدوائية من المواد الأولية في السودان.

5. إعداد خريجين ذوي قدرات عالية تسهم في نهضة وتطوير التعليم الصيدلي.